学校启动校级“青马工程”的同时，也相应启动了院级“青马工程”。 培养对象为学院团学组织学生干部，各班级团支部、班委会成员，优秀学生党员、入党积极分子等，每年培训1400人左右。

材料与冶金学院“青马工程”

城市建设学院“青马工程”

管理学院“青马工程”

化学工程与技术学院“青马工程”

机械自动化学院“青马工程”

计算机科学与技术学院“青马工程”

理学院“青马工程”

外国语学院“青马工程”

汽车与交通工程学院“青马工程”

文法与经济学院“青马工程”

信息科学与工程学院“青马工程”

艺术与设计学院“青马工程”

医学院“青马工程”

资源与环境工程学院“青马工程”